在生物醫(yī)學(xué)研究中,實驗大小鼠的遺傳純度是確保數(shù)據(jù)可重復(fù)性與科學(xué)有效性的生命線。隨著基因編輯、人源化模型及多中心合作研究的普及,遺傳背景混淆、亞系誤用或種群漂變等問題日益突出。因此,在開展
大小鼠遺傳背景鑒定時,必須嚴(yán)格遵循規(guī)范流程,規(guī)避常見誤區(qū)。以下六大注意事項,是保障鑒定結(jié)果準(zhǔn)確可靠的關(guān)鍵。
一、明確鑒定目的,選擇合適大小鼠遺傳背景鑒定技術(shù)
近交系品系確認(如C57BL/6vsBALB/c):推薦使用SNP分型(≥96個位點),精準(zhǔn)度高;
亞系區(qū)分(如C57BL/6JvsC57BL/6N):必須包含Nnt、Cd5等已知差異位點;
封閉群遺傳多樣性監(jiān)測(如SD大鼠):可結(jié)合微衛(wèi)星(STR)與SNP評估雜合度;
避免僅依賴毛色、體重等表型特征——易受環(huán)境干擾,無法反映真實基因型。
二、規(guī)范采樣,杜絕交叉污染
采樣部位:尾尖(2–3mm)、耳緣或口腔拭子,避免血液污染其他樣本;
工具消毒:每只動物更換剪刀或火焰滅菌,防止DNA殘留;
樣本標(biāo)識:立即貼編號標(biāo)簽,同步錄入電子系統(tǒng),杜絕人工記錄錯誤。
三、關(guān)注樣本質(zhì)量與保存
新鮮組織優(yōu)先:冷凍或干燥保存,避免反復(fù)凍融;
DNA提取質(zhì)量:濃度>20ng/μL,OD260/280比值1.8–2.0,確保PCR擴增成功率;
禁止使用降解嚴(yán)重或含PCR抑制物(如糞便、墊料污染)的樣本。
四、選擇數(shù)據(jù)庫比對
比對參考應(yīng)來自資源庫,如:
小鼠:JacksonLaboratory(JAX)、EMMA、MMRRC;
大鼠:RGD(RatGenomeDatabase);
警惕實驗室自建數(shù)據(jù)庫偏差——若無標(biāo)準(zhǔn)品系對照,結(jié)果不可靠。
五、警惕“假一致”陷阱
僅檢測少數(shù)位點(如<20個SNP)可能因巧合匹配而誤判;
同源品系混淆:如DBA/1與DBA/2在部分位點相似,需全譜系覆蓋;
建議采用商業(yè)化標(biāo)準(zhǔn)試劑盒(如CharlesRiver’sSNPPanel、Transnetyx系統(tǒng)),經(jīng)驗證覆蓋關(guān)鍵鑒別位點。
六、建立全流程質(zhì)控體系
設(shè)置陽性(已知品系)與陰性(無模板)對照;
鑒定報告應(yīng)包含原始數(shù)據(jù)、位點列表、匹配概率及置信度;
定期參與能力驗證(如FELASA認證實驗室間比對);
禁止僅憑供應(yīng)商證書替代實際檢測——引種后必須復(fù)核。